Первоначально Конституционный суд был сформирован ещё в 1963 году в соответствии с Конституцией СФРЮ как суд Социалистической республики Словения в составе Югославии для защиты конституционности на уровне республики. Наравне с ним также существовал общефедеральный Конституционный суд Югославии, стоящий на страже конституционности уже на федеральном уровне. 5 июня 1963 года парламент республики избрал первых председателя и членов суда, которые торжественно принесли клятву 15 февраля 1964 года и приступили к своим полномочиям.
В период 1964-1974 годы конституционный контроль был достаточно формальным и не имел существенного влияния на процессы, происходившие в стране, но после принятия новой Конституции СФРЮ 1974 года и усиления роли республик в составе федерации, полномочия Конституционного суда были значительно расширены. С этого времени он уже мог осуществлять абстрактный контроль, рассматривать споры о компетенции между Республикой и административно-территориальными единицами.
Поворотным моментом в истории суда стало провозглашение независимости Республики Словении и принятие собственной Конституции от 23 декабря 1991 года, которая определила Конституционный суд как высший орган судебной власти по защите Конституции, законности и основных прав и свобод человека.
