Министерство обрело свое нынешнее название после принятия послевоенной Конституции Японии в 1952 году. В его обязанности входит администрирование судебной системы Японии и пенитенциарной системы. Оно представляет собой японское правительство в судебном процессе, а также отвечает за поддержание государственной регистрации семей, проживающих в стране иностранцев, недвижимости и корпораций.
Министерство обладает юрисдикцией в отношении Национальной экзаменационной комиссии юристов, Комиссии Общественной экспертизы безопасности и Агентства общественной безопасности. Хотя государственная прокуратура административно являются частью Министерства юстиции, они независимы от власти министра юстиции.
Министр юстиции является членом Кабинета министров и избирается премьер-министром, из числа членов парламента Японии.